这个问题牵涉到孩子病情的性质、医疗条件、技术水平及家庭、社会等各方面因素。
一般来说，病情比较轻，对病儿生长、发育影响不大，短时间内无明显进展的病儿，可不必急于手术，如小型室间隔缺损，缺损在0.5厘米以下有自然闭合的可能，若到6-7岁仍未闭合再做手术也不晚。但对一些畸形复杂、病变较重、有进行性发展趋势的，如大型室间隔缺损、动脉导管未闭伴有肺动脉高压者，这类病儿如不及时手术可加重病情，甚至丧失手术机会。
有的病儿由于存在复杂畸形，一次根治手术死亡率较高，需要分两次手术。如婴儿期的室间隔缺损伴肺动脉高压，可先做一次脉动脉环缩术，减少肺充血，使肺炎和心力衰竭发生机会大大减少，待稍大后再做室间隔缺损修补。又如法乐氏四联症肺动脉发育较差，可在婴儿期先做右心室流出道疏通术或体脉动脉分流术，过几年再做根治手术，往往能收到较好的效果。