子午，即时间变化。流注，即十二经脉气血运行的过程，以及在十二经脉的井、荥、输（原）、经、合等特定腧穴上所呈现的气血盛衰情况，由于年、月、日、时等时间的变化而相应地有所不同。
子午流注针法，指的是以井、紫、俞、经、合五俞穴配合阴五行为基，运用干支配合脏腑，干支计年计月计日计时，以推算经气流注盛衰开合，按时取穴的一种治疗方法。主要包括五枢穴配合阴阳五行、天干地支、天干配脏腑、地支配脏腑四个部分组成。
临床当中对于此法的运用主要有子午流注纳子法和子午流注纳甲法两种。
1.子午流注纳子法
子午流注纳子法，又称子午流注纳支法，指的是按时辰的地支属性来选取十二经脉五腧穴和原穴，每天轮遍十二经脉，是一种按时取穴法。其具体方法是：
（1）在该经脉经气流注时辰，取该经适当的穴位进行针灸治疗。
（2）子母补泻取穴法，实证时，在气血流注至病经的时辰，取病经的子穴进行针灸（泻法）；虚证时，在气血流过病经的时辰，取病经母穴进行针灸（补法）；虚实不著的病证或补泻时辰已过，取病经的本穴或原穴进行针灸。
2.子午流注纳甲法
子午流注纳甲法，又称子午流注纳干法是根据针灸治疗的目时辰与经脉对应关系图枣寅肺、卯大肠的，时天干属性，来选取十二经脉五腧穴和原穴，且以一个时辰为取穴时间单位，10天轮遍六十六穴的按时取穴法。具体方法是：
（1）取穴原则。阳日（日天干属阳），阳时（日天干属阳）取阳经穴；阴日（日天干属阴），阴时（日天干属阴）取阴经穴。
（2）合日互用。甲与己、乙与庚、丙与辛、丁与壬、戊与癸互为合日，在合日间可以互相应用相应时辰的开穴。
