滥用抗菌药导致的严重后果，已逐渐被人们所认识。但是儿童使用抗菌药的特殊性却容易被忽视，有的家长错误地把儿童用药看成是成人用药的缩影，造成儿童用药成人化，以致滥用抗菌药给孩子带来不良反应。
许多抗菌药是通过肝脏代谢、通过肾脏排泄的，儿童处于生长发育阶段，肝、肾功能发育还不成熟，代谢功能不健全，特别容易被部分抗菌药的毒副作用所伤害。同时，滥用抗菌药很容易破坏儿童体内的正常菌群，降低机体抵抗力，导致二重感染(即抗菌药在杀灭病菌的同时也杀灭体内的正常微生物，导致患者真菌感染，如鹅口疮、肠炎等)。
儿童对抗菌药极为敏感，不仅包括注射药品、口服药品，而且包括局部外用软膏、滴眼剂等。儿童应当慎用或禁用的抗菌药主要有：四环素类抗生素
例如：四环素、土霉素、多西环素等，8岁以下儿童禁用。此类药物能与新生成牙齿中的钙结合形成黄色结合物沉着，逐渐变成无荧光的棕色沉着，导致牙釉质发育不良，俗称“四环素牙”。此类药物还能与骨中的钙结合抑制婴儿的骨骼生长。喹诺酮类抗生素
例如：诺氟沙星(氟哌酸)、环丙沙星、氧氟沙星等，12岁以下的儿童禁用。12岁以前，人体骨骼的骨骺软骨细胞不断增殖、肥大、钙化，使儿童不断长高。而此类药物可使儿童骨骺软骨细胞提前骨化，不仅影响儿童长高，还易引起负重骨关节组织的损伤。氨基糖苷类抗生素
例如：庆大霉素、阿米卡星、卡那霉素、新霉素、链霉素等，儿童慎用。此类药物对儿童的不良反应是耳毒性和肾毒性。耳毒性一方面损害内耳的运动平衡系统，表现为眩晕、恶心、呕吐、眼球震颤和共济失调；另一方面损害内耳的听神经系统，表现为听力减退、迟发性和永久性耳聋。肾毒性是由于此类药物与肾组织亲和力极高，从而引起肾组织肿胀，出现蛋白尿、管型尿、血尿、甚至肾脏急性坏死。氯霉素
早产儿(妊娠32-37周之间出生)和新生儿(出生后4周内)禁用，儿童慎用。此药易引起早产儿和新生儿循环系统衰竭，表现为呕吐、腹胀、腹泻、休克、虚脱、皮肤呈灰紫色、甚至死亡，称为“灰婴综合症”。此药还可抑制骨髓，导致儿童发生不可逆性再生障碍性贫血。第一代头孢菌素
例如：头孢噻吩(先锋霉素I)、头孢噻啶(先锋霉素II)、头孢氨苄(先锋霉素IV)、头孢拉啶(先锋霉素VI)，儿童谨慎大剂量使用。此类药物对肾脏有一定的毒性，可引起血尿、肾组织坏死，与氨基糖苷类抗生素或强利尿剂合用时毒性增加。磺胺类药物
例如：磺胺嘧啶、增效联磺等，早产儿和新生儿慎用。此类药物与人体血液中的胆红素竞争血浆蛋白，使胆红素游离，引起早产儿和新生儿黄疸、粒细胞减少等。痢特灵
新生儿慎用。此药可引起新生儿溶血性贫血。
儿童抗感染较适宜使用的抗菌药为青霉素类、红霉素类、第二、三代头孢菌素类药物，急症期使用的时间一般不超过五天，使用剂量必须严格按照儿童剂量计算，并注意观察药物是否有过敏等不良反应。
同时，孕妇和哺乳期妇女也应该避免使用儿童慎用和禁用的抗菌药物，以免这些药物通过母体或母乳影响胎儿或婴儿的生长发育。