研究表明，大量的蛋白尿可以导致肾小球高滤过，促进肾间质炎症细胞浸润和细胞外基质的积聚，使肾小管间质纤维化，这些都可致肾脏疾病进行性发展而加重病情。除了给予低蛋白饮食配合必需氨基酸或酮酸氨基酸营养治疗外，采用血管紧张素转换酶抑制剂（ACEI）及其受体拮抗剂（ARB）、钙通道阻滞剂，既可降低血压，也可减少蛋白尿的发生。
ACEI和ARB
ACEI和ARB都可以显着扩张出球小动脉，降低肾小球毛细血管小球内压力；同时还可以改善肾小球基底膜结构，降低其对大分子的通透性，从而减少蛋白尿。临床常用的ACEI类药物主要有卡托普利（6.52～25毫克，每日3次）、福辛普利（10～20毫克，每日1次）、苯那普利（10～20毫克，每日1次）等。ARB类药物主要有洛沙坦（50～100毫克，每日1次）、缬沙坦（80～160毫克，每日1次）等。
钙通道阻滞剂（CCB）
近年不少研究认为，只要将血压控制在靶目标值，虽然会扩张入球动脉使肾小球内压力增高，但同样可发挥一定的降蛋白尿作用，尤其是在ACEI控制血压不佳时，CCB是较好的联合用药选择。常用的CCB类药物有硝苯地平缓释片（30～60毫克，每日1次）、氨氯地平（5～10毫克，每日1次）、非洛地平（5～10毫克，每日1次）。
其他治疗药物
降脂药降低血脂对于防止肾脏疾病的进行性发展、保护肾功能、减少并发症的发生有重要意义。常用的降脂药有普伐他汀（10～20毫克，每日1次）、辛伐他汀（5～10毫克，每日1次）、氟伐他汀（20～40毫克，每日1次）、阿伐他汀（10毫克，每日1次）等。
抗凝剂肾病综合征常由于高凝状态而引起深静脉血栓形成或血管栓塞，如患者血浆的蛋白低于20克/升应常规使用抗凝剂。预防性抗凝可用普通肝素或低分子肝素以及阿司匹林、双嘧达莫等。出现血栓并发症，可选用尿激酶、低分子肝素，但应防止抗凝药物过量导致出血。
抗氧化剂清除氧自由基、发挥抗氧自由基的作用，可减轻肾小管的氧化损伤，可用维生素E（50毫克，每日2～3次）或还原型谷胱甘肽（1.2克加入葡萄糖液中静注，每日1次，疗程14天）等。