三七GAP栽培除了对土质本身的要求外，还对土壤耕作层的有毒物质含量有严格要求。主要包括重金属元素，如汞、镉、铅、砷等；土壤中有机氯和有机磷化物，如六六六、滴滴涕等的残留，其具体限量指标为：六六六≤0.2毫克/千克、滴滴涕≤0.2毫克/千克、铅≤50毫克/千克、铜≤80毫克/千克、镉≤2毫克/千克、汞≤1毫克/千克、砷≤20毫克/千克。
除酸白泥土和粘重土之外，其它土壤均可种植三七。但以土质疏松、排灌方便的壤土为好。因此在选择地块时，以土质疏松、有机质含量较为丰富、排水和保湿的土壤为宜。在达到生产环境规定的范围内，选择中偏酸性沙壤土，排灌方便，具有一定坡度（坡度不得大于15），8年内未种过三七的地块。
传统的三七栽培对种植土壤的要求一般包括地势、间隔年限、土壤肥力、土壤类型及水源情况、交通情况等，GAP三七栽培在对土地的选择要求除了对上述几个方面要求外，还特别强调土壤中农药和重金属的残留情况，三七GAP栽培的过程中，控制种植地块的农药残留量和重金属含量是整个栽培技术之中最基本的环节，也是最有效的方法之一，如果土地中农药残留量和重金属含量本来就高，那么其后的控制农药、肥料使用及采收后清洗等技术措施完全是徒劳的。因此，土地中农药残留量和重金属含量是基地选择的基本依据。如果检测结果超过规定标准则不能进行GAP三七栽培。然而该部分的内容是传统栽培中所不涉及的，故对种植地块的土壤取样和质量检测是进行GAP三七栽培的技术措施之一。