在大蒜的鳞茎中含有蒜氨酸和蒜酸，这两种成分在鳞茎中各自存在，互不相干。只有把鳞茎捣碎使两者接触，蒜氨酸才能在蒜酸的作用下分解，生成有挥发性的大蒜辣素。大蒜辣素是一种无色油状液体，比水重，具有较强的杀菌能力，在酸性条件下呈液体状态。大蒜辣素进入人体能与细菌体内的半胱氨酸反应生成结晶性沉淀，破坏细菌的生长和代谢。
因此，在食用大蒜时应将其捣碎，这不单是为了食用方便，而是科学食用。此外，在食用时应尽量避免与碱性食品同食，以防影响其杀菌效果。