药物之间的配伍禁忌遵循金元时期总结概括出来，沿用至今的“十八反”“十九畏。”
十八反的内容是：甘草反甘遂、大戟、海藻、芫花；乌头反贝母、瓜篓、半夏、白蔹、白芨；黎芦反人参、沙参、玄参、丹参、细辛、芍药。
十九畏的内容是：硫磺畏朴硝，水银畏砒霜，狼毒畏密陀僧，巴豆畏牵牛，丁香畏郁金，川乌、草乌畏犀角，牙硝畏三棱，官桂畏石脂，人参畏五灵脂。