近年来中西医结合治疗消化系统疾病已取得了卓越的临床疗效，在某些疑难病方面亦显露出更大的优势和苗头。现择其著者，以示其概：
胃病方面，中西医结合在治疗慢性萎缩性胃炎及胃癌前病变中，临床证候改善较西药快速而显着，胃黏膜的急性炎症性病变消退明显，对胃黏膜萎缩、肠上皮化生及异型增生也显示出一定的缓解和逆转作用。中药对消化性溃疡的治疗效果明显，并能减少复发。中西药结合抗Hp的三联疗法不仅其根除率可达到90％以上，而且具有副作用少、费用低、疗效稳定和依从性好的优点。肠病方面，中药的全身辨证用药加局部灌肠给药或中西药结合疗法对慢性非特异性溃疡性结肠炎的疗效优于或相似于西药，其疗效稳定、副作用少，具有更大的优越性。中药对改善胃肠道各部位的动力紊乱均具有很强的调理作用，尤其中药的双向调节作用，更为其他西药所莫能及，具有很大的潜在价值，值得深入发掘。
中西医治疗病毒性肝炎在改善临床症候和肝功能损害上，疗效较西药明显，在增强人体自身免疫力和调节营养代谢失调方面也不逊色，尤其是防治肝纤维化和肝硬化，更显示出卓著的效果，非西药所能及。
此外，胆胰疾病方面，中西药结合治疗急性胆囊炎和胆石症有良好的效果，虽炎症消退与西药相差无几，但症状好转快，疗效巩固。对急性水肿性胰腺炎仅用中药就能治愈，中西药结合治疗急性重型胰腺炎，可明显提高疗效，减少合并症，降低死亡率。实验研究证明，通里攻下法和活血化瘀法对重型胰腺炎并发的肺损伤、胰腺血循障碍，肠屏障破坏都有很好的保护和改善作用，为疗效提供了细胞分子学的理论依据。在以上这些消化系统疾病的治疗中，中西医结合取得的疗效为发展新的学术思想打下了良好的基础，因为有了好的疗效，并能阐明其疗效机制，其中就必然存在某种值得探索的科学理论依据。
中西医结合防治消化系统疾病虽然取得了不少的进展，但距离创建中西医结合新消化病学的要求仍然相差很远。所以，我们认为今后要搞好中西医结合工作，首先要抓住重点，认准突破口，狠下功夫，才能取得更大的成绩。首先，要在“疑难病”治疗中发挥中西医结合的优势，例如中医或中西医结合治疗慢性萎缩性胃炎虽有一定疗效，但其确切效果仍需进一步扩大验证，其重点应放在癌前病变防治上。消化性溃疡病的近期愈合，中西医疗效大致相似，但复发率很高。因此，提高和巩固疗效，防止复发是中西医结合治疗消化性溃疡病的发展方向。加强对胃肠道癌前病变、出血性坏死性肠炎和伪膜性肠炎等疑难疾病的防治和研究。
目前认为慢性非感染性、尤其是胃肠道功能性疾病，大多数病因及发病机理尚未彻底阐明，但这类疾病临床上发病率很高，症状繁多，反复迁延，常给病人带来痛苦，一般西药治疗效果并不满意。而中医和中西医结合治疗可通过辨证论治，也就是结合患者的社会心理、体质、生物和环境等诸多影响因素，加强“针对性”、“个体化”和“综合性”治疗，常能取得突出效果，这正反映了中医辨证论治的优势和特色，是很值得进一步深入研究的课题。