下面介绍回回医学中的重要医著，其中三部问世于元代。
《回回药方》（以下简称《药方》）。中国回族医药学大型综合性典籍，未著撰人，红格明抄本，原书36卷，残存4卷，现于北京图书馆。全文基本上用汉文记述，并夹杂不少阿拉伯、波斯药物名称术语的原文和音译词汇。现残存卷为：目录卷之下、卷12、卷30、卷34。目录卷下包括卷19至36据目录可见，卷19为咳嗽门，包括众嗽、湿嗽、喘嗽、嗽血、嗽痰、肺经肿嗽、说治咳嗽等类。卷20为胸膈凝聚、胸膈热促、胸弱、胸疼痛、胸奄浊、胸冷湿、胸中生疮、开胸膈等类。卷21为肠风肚腹门，包括肠风、肠中生疮、肠中生虫等。卷23为泻痢门，包括论、方及泻从遍身来的、胃经泄泻、肠经泄泻等类。卷23为呕吐门、痞证门、秘门、劳瘵门、补益门；呕吐门包括呕吐、吐泻、泄泻、止吐、止泻等类；痞证门包括痞证类；秘门包括脏腑不通类、能通小水类；劳瘵门包括劳热、劳虫、劳嗽等类；补益门包括补益类。卷24为众热门、众冷门。众热门包括一切热类；众冷门包括胸膈冷类、胃经冷、一切冷等类。卷25为众气门、众血门、时气斑疹门、疟疾门。众气门包括众气、气不依常度、气喘急等类；众血门包括治吐血、能吐血、下血、止血等类；时气斑疹门包括时气、斑疹等类；疟疾门包括疟疾类。卷26为身体门，包括身体肥瘦、身体疼痛、癍痕花绣、治体气、治生虱、手足等类。卷27为黄病门、蛊症门、积聚门，黄病门包括黄类，蛊症门包括蛊症等类；积聚门包括积聚类。卷28为脚气门、脱肛痔漏门、谷通门。脚气门包括身体疼痛脚气、热肿脚气、冷肿脚气、寒湿脚气、一切脚气等类；脱肛痔漏门包括痔疮、肠风痔漏、痔风、脱肛等类；谷通门包括谷通等类。卷29为杂症门，包括论16条，方189首。卷30为杂症门，载方307首。卷31为妇人众疾门、小儿众疾门。妇人众疾门包括妇人身内动静、乳上症候、怀孕动静、子宫症候、众疾等类；小儿众疾门包括小儿众疾类。卷32为众疮肿肿毒门。包括肿毒、疬疮、恶疮等，卷33为众疮肿毒门、疥癣门。众疮肿毒门包括疥疮、甜疮、疳疮、癞疮、臭疮等类。疥癣门包括疥疮、癣疮、一切疥癣等类。卷34金疮门、折伤门、针灸门、汤火所伤门、棒疮门、治人齿所伤门。金疮门包括刀箭所伤、取箭头刺签等类；折伤门包括伤损、接骨、骨脱出等类；针灸门包括灸各种症候类；汤火所伤门包括汤火所伤类；棒疮门包括棒打伤类；治人齿所伤门包括治人齿咬伤类。卷35为众虫兽伤门、众毒门、辟虫门。众虫兽所伤门包括众虫兽伤类；众毒门包括论及说众毒物、辨验何等毒物所伤、解服药毒、解众虫兽所伤等类；辟虫门包括辟众虫、辟恶物等类。卷36为修合药饵门、修合诸般马准门、众香汤煎门、活物治病门、众花果菜治病门。修合药饵门包括论及制药法，相合药法、比量用药、说造良方。药性期度、药饵分两等类；修合诸般马准门包括论及方87首（均已分见各门）；众香汤煎门包括汤药类；活物治病门包括活物治病类；众花果菜治病门包括众果物类、众菜类、众花物等类。
从上述部分药目录所涉及的病种门类可以看出，《药方》是一部包括内、外、妇、儿、骨伤、皮肤等科，内容丰富的中国回族医学方书。从现存3卷所载方剂看，全书所载可能达，6000～7000首之多。其系统性、综合性不亚于中医古籍《外台秘要》。