十二经别是十二正经离、入、出、合的别行部分，是正经别行深入体腔的支脉。
十二经别的分布规律：十二经别多从四肢肘膝关节以上的正经别出（离），经过躯干深入体腔与相关的脏腑联系（入），再浅出体表上行头项部（出），在头项部阳经经另合于本经批脉，阴经的经别合于其表里的阳经经脉（合），由此将十二经别汇合成6组，称为（六合）。足太阳、足少阴经别从腘部分出，入早间肾与膀胱，上出于项，合于足太阳膀胱经；足少阳、足厥阴经别从下肢分出，行地至毛际，入早间肝胆，上系于目，合于足少阳胆经；足阳明、足太阴经别从髀部分出，入走脾胃，上出鼻頞，合于足阳明胃经；手太阳、手少阴强从腋部分出，入走心与小肠，上出目内眦，全于手及阳小肠经；手少阳、手厥阴经别从所属正经分出，进入胸中，入走三焦，上出耳后，合于手少阳三焦经；手阳明、手太阴经别他别从所属正经分出，入走肺与大肠，上出缺盆，合于手阳明大肠经。
十二经别的作用：加强了十二经脉的内外联系及在体深内的脏腑之间表里关系，补充了十二经脉在体内外循行的不足。由于十经别通过表里相合的“六合”作用，使得十二经脉中的阴经与头部发生了联系，从而扩大了手足三阴经穴位的主治范围。此外，又由于其加强了十二经脉搏对头面的联系，故而也突出了头面部经脉和穴位的的重要性及其主治作用。