当病人入院后，物理治疗师会进行一个仔细的检查，其中包括病历及家庭工作背景。根据这些资料，身体机能所产生的问题如感觉、肌张力、动作的模式、平衡力、协调功能、步态、痛症、关节幅度等等会被评定、记录下来，然后确定治疗目标、治疗计划，尽量去达到所预定的短期及长期目标，就是使病人达到最高独立能力。
藉着教授正确的动作模式及防止不正确的动作模式，病人渐渐地学会如何做到理想的肌肉控制及平衡活动。一些特别的治疗技巧，例如松弛被动式运动可用于减轻肌肉张力和保持关节幅度。
另一面，拍打法及抹法可用于促进肌肉收缩能力。对于掌握合适的自主运动，主动式运动起着重要的作用，而这需要治疗师人手指引和病人自己的参与。此外，物理治疗师也利用温热疗法去减少疼痛和发炎，而这些经常在肩关节产生（偏瘫后的肩手综合征）。步态姿势会重新被教育，到最后期，若病人仍出现足下垂或踝关节内翻的现象，矫形师会为病人做一个脚托，去保持踝关节在步行时的正常角度。
若有需要，不同种类的步行辅助器具如拐杖、四脚叉、步行架会由治疗师指定签发给病人使用。为此达致较高的独立能力，治疗师会教导病人如何使用楼梯及斜坡。