中药丸药的保存应密闭，防潮，置于室内阴凉干燥处。往往因为存放方式不当或存放时间过长，发生腐败变质，已经变质的丸药不能服用。因为变质的丸药已经完全失效，不但不能治病，还能产生疾病。如何识别丸药是否变质，除了视其生产日期外，常从以下三个方面入手：
（1）看：看其外观色泽。首先看其外部的包裹物有否异常，如其外面的包装小纸盒或蜡壳已经霉变，那么里面的丸物十有八九也已经不新鲜。其次看其外观色泽，如正常的蜜丸表面应该光滑圆润，呈棕黄色至黑棕色。以朱砂为衣或金箔为衣时分别呈朱红色、金黄色。贮存日久或包装不严密的蜜丸可因失去水分而变硬，表面无光滑润泽感，贮存不当或制作不卫生时常常有生虫或霉变现象。
（2）嗅：正常新鲜的丸药有一股特殊的中药香味，如是蜜丸应当还有蜜的香味。如有怪味、酸腐味而没有正常的中药味，表示已经变质。
（3）尝：直接用嘴尝，通过味觉予以判断。正常的丸药味浓郁，变质的丸药有酸腐味，无发粘感。起后空腹服药，更是如此。