通常，怀孕以后一旦生了病，在用药时孕妇是很谨慎的，因为怕影响胎儿，引起畸胎。实际上，并非是在整怀孕期间用药都危险。
由于胚胎各器官发育时间不一，致畸胎的易感期也不同。例如，中枢神经系统的致畸易感期为受精后15-55天，心脏为20-40天，眼为24-39天，四肢为24-46天，外生殖器为36-56天。妊娠3个月以上的胎儿，各器官已经形成，此时对外界环境的致畸影响大为减少。但是，由于药物等因素有时还会影响器官的功能，如引起耳聋、肾功能减退等，所以，妊娠12周后用药还应十分慎重。
有时候药物致畸作用受一些条件的影响。如有的药物不易透过胎盘屏障；有的透过的量还不多，不一定达到致畸的有害浓度；有的即使透过的量较大，但对胎儿不一定有害，如庆大霉素对妊娠早期不引起致畸作用，只有在妊娠后期，才有可能会引起胎儿耳聋。
总的来讲，为确保妊娠期母婴安全，应提倡在妊娠期(尤其是妊娠3个月)少用药或不用药。但是，不治疗对母婴也会造成不利的影响，应该遵医嘱，既不要忌医禁药，又要谨慎用药。