菠萝中含有五羟色胺等易使人过敏的物质，食后可出现口腔发痒，血压升高，甚至出现急性阵发性腹痛、呕吐、荨麻疹、四肢及口腔麻木，多汗等症状。因此有高血压和严重过敏体质者不宜多食菠萝。
吃新鲜菠萝时应先将其去皮，再切片放入开水中煮沸。为保持新鲜口味，也可将菠萝浸入盐水30分钟后取出，用凉开水浸泡去降咸味，这样可防止过敏的发生。