心理咨询师证书的选择主要取决于你的个人职业规划和发展方向，在当今社会，随着人们对心理健康问题的关注度逐渐提高，心理咨询师的需求也在不断增加，如果你希望在未来的职业生涯中从事与心理学相关的咨询工作，那么选择获得心理咨询师证书更为重要。

而中国科学院和中国科学技术大学作为中国顶级的两所科研机构，都有着非常丰富的教育资源和专业能力，因此它们的师资力量和技术实力也是不容忽视的，具体的哪个更好，还需要根据你的具体情况来判断。

如果你希望进入研究型的心理学领域发展，那么中国科学院可能更适合你；如果你希望进行教学或者临床工作，那么中国科学技术大学可能更合适，你可以考虑一下这两个学校的排名情况、师资力量以及学术氛围等因素。

选择心理咨询师证书时，你需要综合考虑自己的需求、目标和资源，然后做出最适合自己的决定，无论选择哪个学校，都要努力提升自己，才能在激烈的竞争中脱颖而出。