包皮过长极易引发性传播疾病。研究表明，包皮环切后，尖锐湿疣、获得性免疫缺陷综合征、梅毒、软下疳、生殖器疱疹等性传播疾病的发病率降低，由此可见，包皮过长是上述性传播疾病的危险因素。

这是因为，当包皮过长时，包皮腔内潮湿的环境易于感染上述性传播疾病的病原体。角蛋白是防止HIV-病毒感染的非通透性屏障。

无论是否做过包皮环切术，阴茎头均富含角蛋白，因此，除非发生炎症或其他损伤，阴茎头部位不易成为HIV-病毒的人侵部位。与之相反，由于包皮内板及包皮系带缺乏角蛋白，因而易于成为HIV-病毒的入侵的部位。

包皮过长时，由于包皮内板长度增加，性交时与阴道黏膜上皮接触面积增加，因此，从对方感染HIV-病毒的机会增加。包皮环切术后，由于切除了过长的包皮内板，勃起时覆盖阴茎体的主要是富含角蛋白层的外板皮肤，从而减少了HIV-病毒感染的机会。

包皮过长时，尖锐湿疣、梅毒、软下疳、生殖器疱疹等其他性传播疾病发病增加可能与过长的包皮内板黏膜比较脆弱，易于受损伤有关。