自建房没有房屋所有权证书不能合法开设健身房，这是近年来被广泛诟病的问题，许多地区已经明令禁止，原因有三。

无证经营是非法的，根据《建筑法》的规定，任何单位和个人都不得未经批准擅自建造建筑物或者改变建筑物用途，而建设健身场所属于公共场所，需要满足一定的条件和规定，如符合规划、取得相关手续等，自建房作为个人住所，如果没有相应的房产证或土地使用权证明，无法合法设置健身房。

合法性问题，如果自建房用于开设健身房，那么在法律上它没有产权归属，所有的投入可能构成个人投资，这种情况下，如果因为经营不善等原因导致亏损，投资人将难以追究责任，如果健身房发生侵权行为，消费者也无法主张权益。

消防法规也受到严格限制，许多城市和地区都有一套严格的消防安全规定，例如对于面积超过一定规模的场所，必须进行消防验收，并取得消防合格证书才能投入使用，而且，健身房内产生的大量人员活动，也需要符合消防安全要求。

有一些地方已经对这个问题有所突破，一些地方开始允许自建房中的部分空间，作为经营场所使用，但这种方式也有其局限性，政府往往只提供场地租赁合同，而不是产权证明，而且对未取得许可的部分只能进行有限的经营，甚至无法进行营业。

为了保护消费者权益，近年来各地政府也开始加强对健身房的监管，北京市就要求所有开设健身房的企业必须有合法的身份证明，并且对其经营状况定期进行检查，政府部门也会不定期对健身房进行安全检查，以确保其符合安全标准。

自建房不能直接开设健身房是一个严重的问题，需要得到妥善解决，我们需要明确自建房的合法性问题；我们也要注意到这个问题对于消费者权益的影响，未来的政策制定者应该对此做出更多积极的努力，为公众创造一个更加公平、健康的生活环境。