中医特色调理师证和小医师证的主要区别在于其等级和适用范围。

中医特色调理师证属于高级别的专业资格证书，主要针对的是从事中医疗法的实践工作，持有此证的人需要具备扎实的中医基础知识和临床技能，能够运用中医理论和方法进行疾病的诊断、治疗和预防。

而小医师证则属于初级的职业资格证书，主要适用于在医疗机构或者社区卫生服务中心等基层医疗机构工作的医生和护士，持有此证的人需要具备相应的医学知识和技能，并且需要通过国家执业医师考试或者助理医师考试。

中医特色调理师证是中医人才的重要组成部分，而小医师证则是中医医生的基本准入门槛之一，两者都是中医职业发展的重要里程碑，对于提高我国中医医疗服务质量和水平具有重要意义。