如果您的三级心理咨询师证书丢失了，您需要按照以下流程进行补办手续：

1、报案：您需要到当地公安机关报案，说明您的证书丢失情况，公安机关会为您开具一份《丢失证件报案回执》，并在系统中记录您的丢失信息。

2、准备材料：根据相关规定，您需要准备以下材料：

- 《丢失证件报案回执》原件；

- 身份证原件及复印件；

- 一寸免冠彩色照片2张；

- 其他相关证明材料(如学历证书、职业资格证书等)。

3、填写申请表：携带以上材料，到当地人力资源和社会保障局(原劳动部门)领取《心理咨询师职业资格证书补发申请表》，按照要求填写个人信息和丢失情况，并加盖单位公章。

4、提交申请：将填好的申请表和相关证明材料一起提交给当地人力资源和社会保障局(原劳动部门)，工作人员会对您的申请进行审核，审核通过后，会为您开具《补发心理咨询师职业资格证书通知单》。

5、支付费用：根据相关规定，您需要支付一定的补发费用，具体费用标准可以咨询当地人力资源和社会保障局(原劳动部门)。

6、领取证书：在规定的时间内，凭《补发心理咨询师职业资格证书通知单》和缴费凭证，到当地人力资源和社会保障局(原劳动部门)领取您的新证书，您需要注销原证书。

7、更新信息：拿到新证书后，您需要将其相关信息录入中国心理学会官方网站的会员管理系统，以便相关部门进行信息更新。

需要注意的是，不同地区的具体办理流程和所需材料可能略有差异，建议您提前向当地人力资源和社会保障局(原劳动部门)咨询具体细则，以确保顺利完成补办手续。