三级心理咨询师证书签发机构是指在国家职业资格认证体系中，负责对具备一定心理学知识和技能的人员进行专业培训、考核和颁发相应资格证书的机构，三级心理咨询师证书签发机构主要包括以下几类：

1、各省、自治区、直辖市人力资源和社会保障厅(局):这些部门通常负责本地区的职业资格考试工作，包括心理咨询师职业资格考试，考试合格者，由省级人力资源和社会保障厅(局)颁发相应的职业资格证书。

2、国家卫生健康委员会主管的全国心理健康教育中心：全国心理健康教育中心作为国家级的心理健康教育机构，负责组织和实施全国范围内的心理健康教育工作，包括心理咨询师培训和考试，考试合格者，由全国心理健康教育中心颁发相应的职业资格证书。

3、各级职业技能鉴定中心：职业技能鉴定中心是国家职业技能认证体系的重要组成部分，负责对各类职业技能人员进行培训、考核和颁发证书，部分地区设有心理咨询师职业技能鉴定中心，负责组织和实施心理咨询师职业技能鉴定工作，考试合格者，由职业技能鉴定中心颁发相应的职业资格证书。

4、社会培训机构：为了满足市场需求，一些社会培训机构也提供心理咨询师培训课程，并协助学员参加考试，这些培训机构可能会与上述政府部门合作，共同组织考试和颁发证书，但需要注意的是，这类机构的证书可能在权威性和认可度上略低于政府部门颁发的证书。

5、中国心理学会等专业组织：中国心理学会等专业组织作为心理咨询行业的权威组织，也会参与心理咨询师培训和考试工作，部分地区或机构可能会与这些专业组织合作，共同颁发证书。

三级心理咨询师证书签发机构涵盖了政府部门、国家级心理健康教育机构、职业技能鉴定中心和社会培训机构等多个方面，考生在选择培训机构时，应充分了解各方面的情况，选择具有较高权威性和认可度的机构进行培训和考试，以确保所获得的证书具有较高的职业价值，考生还需关注相关政策和法规的变化，确保自己的职业发展与市场需求保持一致。